Pondok ini didirikan oleh Mbah Yasin pada tahun 1918H. Awal mula Mbah Yasin mendirikan pondok ini didasari dari saran guru beliau yaitu Mbah Sanusi yang melihat antusias anak-anak yang ingin belajar agama Islam pada masa itu.
Hingga saat ini, santri pondok tidak hanya berasal dari daerah Jekulo saja namun banyak dari luar daerah maupun luar kota yang nyantri disini. Banyak juga kalangan mahasiswa yang kuliah dan sekaligus mencari ilmu agama di Pondok Pesantren Al-Qoumaniyyah.
Itulah 9 pondok pesantren terbaik di Kabupaten Kudus. Dapat Anda jadikan referensi dan pilihan jika ingin memondokkan anak tercinta di Kota Santri. (*)